Agus Pakpahan menyelesaikan S-1 jurusan Manajemen Hutan Fakultas Kehutanan, Institut Pertanian Bogor (IPB, 1978) dan S-2 di bidang ekonomi pertanian IPB (1981). Gelar PhD bidang ekonomi pertanian dengan spesialisasi Ekonomi Sumber Daya Alam diperoleh di Department of Agricultural Economics, Michigan State University, Amerika Serikat (1988). Kelahiran Sumedang, Januari 1956, ini mengawali karier sebagai peneliti pada Pusat Penelitian Agroekonomi, Badan Litbang Pertanian, Kementerian Pertanian pada 1979. Mengabdi di Bappenas (1992-1997) dan menjabat Kepala Biro Bantuan dan Regional I (1994-1995) dan Kepala Biro Kelautan, Kedirgantaraan, Lingkungan Hidup dan Iptek (1996-1997). Pada 1998-2003 diberi kepercayaan menjabat Direktur Jenderal Perkebunan dan Deputi Menteri BUMN Bidang Usaha Agroindustri, Kertas, Percetakan dan Penerbitan (2005-2010). Sempat aktif mengajar Ekonomi Pilihan Masyarakat (Economics of Public Choice) pada Program Pascasarjana, IPB, jurusan Perencanaan Wilayah dan Perdesaan. Visiting scholar di Cornell University, Amerika Serikat (1992) dan Australian National University (1992). Pada 2013, meraih gelar profesor riset dengan orasi berjudul “Membalik Arus Guremisasi Petani dan Pertanian.” Banyak menulis artikel ilmiah selain menulis novel. Alexander X: Helper of Mankind. Defender of Man (Balai Pustaka, 2009) dan Petaka Gunung Tampomas—Kasus Lokal Cermin Global: Sedia Payung Sebelum Hujan (Pustaka Obor Indonesia, 2022) adalah dua judul novel karyanya. Sejak 29 Mei 2023, diberi amanah sebagai Rektor Universitas Koperasi Indonesia (IKOPIN University), Jatinangor, Sumedang, Jawa Barat. Pada pertengahan Oktober 2023, terpilih sebagai Ketua Asosisasi Dosen dan Peneliti Koperasi Indonesia (ADOPKOP, 2023-2026).