Madrasah dan pesantren umumnya berada di pedesaan, muridnya dari keluarga tidak kaya. Anak didik ini, setelah menamatkan tingkat dasar, tak sempat melanjutkan pendidikannya ke sekolah umum profesional di kota. Menurut Zamakhsyari Dhofier, adanya madrasah sebenarnya merupakan tawaran pendidikan yang terjangkau oleh kemampuan keuangan mereka. Saat ini lulusan madrasah dan pesantren mampu menamatkan pendidikan di tingkat perguruan tinggi, IAIN misalnya, malah memperdalam ilmunya di luar negeri. Perkembangan ini akan mempengaruhi rumusan dan corak keislaman Indonesia di masa mendatang.